食品衛生法に基づいて、食中毒をはじめとする食品衛生上の問題を防ぐことを目的に、専門の検査や指導を行うのが食品衛生監視員の主な仕事。次項の国家公務員専門職者が主に輸入食品の検疫を行うのに対し、自治体の地方公務員として国内の食品の衛生監視を行い、通称「食品Ｇメン」とも呼ばれる。

たとえば保健所が、食品生産者や製造業者、販売業者などに立ち入り検査や指導を行う際に食品衛生監視員が活躍。調査や行政処分などのさまざまな対応に当たったりする。

食品衛生監視員として働くには、大学で薬学、畜産学、水産学など所定の課程を修めたのち、自治体の関連機関に公務員として採用されることが必要。薬剤師や獣医師などの有資格者が業務に就いているケースが多い。